Journal of Water and Soil Science
علوم آب و خاک
jwss
Agriculture
http://jstnar.iut.ac.ir
0
user
2476-3594
2476-5554
10.47176/jwss
fa
jalali
1386
10
1
gregorian
2008
1
1
11
42
online
1
fulltext
fa
مطالعه تنوع ژنتیک باکتریهای سینوریزوبیوم با استفاده از تکنیک PCR / RFLP 16S-23S rDNA
Study of Genetic Diversity of <i> Sinorhizobium </i>Bacteria Using PCR / RFLP 16S-23S rDNA Technique
عمومی
Ggeneral
پژوهشي
Research
<p style="DIRECTION: rtl"> مطالعه تنوع ژنتیک باکتریهای ریزوبیومی و ارزیابی کارآیی همزیستی آنها در جمعیتهای بومی خاک به منظور شناخت پاسخ آنها به سویههای تلقیح شده به خاک و همچنین نقش مدیریتهای متفاوت بر تنوع این باکتریها از اهمیت ویژهای برخوردار است. مطالعات بسیار اندکی پیرامون تنوع ژنتیکی باکتریهای ریزوبیومی بومی ایران انجام شده و گزارشی راجع به باکتریهای بومی ریزوبیومی از لحاظ ژنتیکی ارائه نشده است. به همین منظور تنوع ژنتیکی 150 جدایه باکتری سینوریزوبیومی جدا شده از خاکهای استان همدان با به کارگیری تکنیک PCR / RFLP 16S-23S rDNA مطالعه شدند. نتایج حاصل از آزمایش نشان داد که به طور کلی جدایههای مورد مطالعه در سه گروه کاملاً متفاوت قرار گرفتند. گروه اول 122 جدایه از 150 جدایه را شامل شد و این گروه خصوصیات ژنتیکی <i>Sinorhizobium meliloti </i>را نشان دادند. گروه دوم (II) شامل 25 جدایه بود و این گروه هم متعلق به <i>Sinorhizobium medicae </i>بود. گروه سوم ( III ) شامل دو جدایه بود که خصوصیات ژنتیکی کاملا متفاوت با دو گروه قبلی داشت. شاخص تنوع شانون جدایههای مورد مطالعه در بین یازده واحدهای فیزیوگرافی مختلف (تپه، اراضی نسبتاً مسطح، فلات، کوهپایه، اراضی پست و اراضی متفرقه) متفاوت بوده و با برخی از خصوصیات خاکی همبستگی نشان داد. شاخص تشابه متفاوت در بین واحدهای فیزیوگرافی بیانگر تفاوت در گروههای موجود در هر واحد فیزیوگرافی بود. </p>
<p> It is important to investigate the genetic diversity and evaluate symbiotic effectiveness of the indigenous rhizobial population. It helps understand the responses of indigenous isolates to different rhizobial inoculants. In spite of the importance of bacterial diversity, there are a few scientific reports about it in Iranian soils. Genetic diversity of 150 isolates of <i>Sinorhizobium</i> isolated from Hamadan soils was studied by using PCR / RFLP 16S-23S rDNA technique. The results showed that all isolates clustered in three different groups. Group (I) formed 122 isolates and they were quite similar to <i>Sinorhizobium meliloti </i>from viewpoint of genetic characteristics. Twenty five isolates were clustered in Group (II) and they belonged to <i>Sinorhizobium medicae. </i>Group (III) had two isolates and they were new species and quite different from the other groups. Shannon diversity index was different within eleven different land units (Medium gradient mountains, Level lands, Plateau, Foot slopes, Depressions and Composite land) and there was a correlation between Shannon index and some soil properties. Difference in Similarity index showed that <i>Sinorhizobium</i> groups in each land unit were different. </p>
شاخص تنوع شانون، شاخص تشابه، واحدهای فیزیوگرافی
Shannon diversity index, Similarity index, Land unit.
441
449
http://jstnar.iut.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-2-798&slc_lang=fa&sid=1
E.
Karimi
اسماعیل
کریمی
00031947532846005632
00031947532846005632
No
A.
Lakzian
امیر
لکزیان
00031947532846005633
00031947532846005633
Yes
K.
Khavazi
کاظم
خاوازی
00031947532846005634
00031947532846005634
No
A.
Asgharzadeh
احمد
اصغرزاده
00031947532846005635
00031947532846005635
No
G.H.
Haghnia
غلامحسین
حق نیا
00031947532846005636
00031947532846005636
No