Journal of Water and Soil Science
علوم آب و خاک
jwss
Agriculture
http://jstnar.iut.ac.ir
0
user
2476-3594
2476-5554
10.47176/jwss
fa
jalali
1382
4
1
gregorian
2003
7
1
7
2
online
1
fulltext
fa
تعیین تنوع ژنتیکی قارچ عامل بیماری برقزدگی نخود <span dir=ltr>[<i>Ascochyta rabiei</i> (Pass.) Lab.]</span> ایران با استفاده از مارکرهای مولکولی RAPD
Identification of Genetic Diversity in the<i> Ascochyta </i>Blight Pathogen of Chickpea [<i>Ascochyta rabiei</i> (Pass.) Lab.] Using RAPD Markers
عمومی
Ggeneral
پژوهشي
Research
اطلاعات اندک موجود در مورد تنوع قارچ <em>Ascochyta rabiei</em> یکی از مهمترین عوامل محدود کننده برنامههای اصلاحی برای مقاومت نسبت به بیماری برقزدگی نخود است. در این پژوهش تنوع ژنتیکی جمعیت این قارچ در ایران بررسی شده است. بدین منظور، 26 جدایه از 16 استان کشور انتخاب و تنوع ژنومی آنها با استفاده از روش RAPD ارزیابی شد. با به کارگیری 12 آغازگر تصادفی، الگوی باندی DNA جدایهها تهیه شد، و بر این اساس تنوع ژنتیکی و فاصله ژنتیکی بین جدایهها محاسبه و روابط خویشاوندی آنها با استفاده از تجزیه خوشهای تعیین گردید. نتایج نشان داد که روش RAPD ابزاری قوی برای تجزیه ژنومی جمعیت <em>A. rabiei</em> است. در میان آغازگرهای به کار برده شده 10 آغازگر پلیمورفیسم نشان دادند. بر اساس دادههای به دست آمده، شاخص تنوع ژنتیکی جدایهها 98 درصد برآورد شد، که نشان دهنده تنوع ژنتیکی زیاد این بیمارگر در ایران است. فاصله ژنتیکی بین جفت جدایهها از 16/0 تا 61/0 متغیر بود. بیشترین فاصله ژنتیکی بین جدایههای 20 و 22 (از استانهای قزوین و گلستان)، و کمترین فاصله بین جدایههای 12 و 26 (از استانهای مرکزی و مازندران) دیده شد. در سطح شباهت 90 درصد، کل جدایهها در 22 گروه ژنوتیپی جداسازی و از حرف A تا V نامگذاری شدند، و نیز الگوی پراکنش آنها در ایران مشخص شد.
The poor information available on variation of <em>Ascochyta</em> blight fungus is the most important factor limiting chickpea breeding programs for resistance to blight disease. In this study, efforts were made to detect genetic variation of the pathogen in Iran. The RAPD marker was employed to evaluate 26 isolates collected from 16 provinces. Twelve random primers were used to analyze genomic DNA of the isolates. Only ten primers showed polymorphism among isolates. Primer OPK-01 defined the highest number of polymorphism and primer OPK-09 confirmed relatively low degree of polymorphism. On the basis of this molecular marker, the estimated genetic diversity index was 98% and the pair-wise genetic distance of the isolates varied from 0.16 to 0.61. The least genetic distance belonged to isolates 20 and 22 from Qazvin and Golestan while the highest distance belonged to isolates 26 and 12 from Mazandaran and Markazi. The phylogenic tree was constructed by cluster analysis and all the isolates grouped to 22 genetic clusters at the 90% similarity level. The genetic groups were named from A to V and their distribution in Iran was determined. The results revealed that genetic variation among Iranian population of the pathogen is very high, and further that RAPD is a vigorous tool for genomic analysis of <em>Ascochyta rabiei</em>.
Ascochyta rabiei ، تنوع ژنتیکی، فاصله ژنتیکی، RAPD
Ascochyta blight, Genetic diversity, Genetic distance, RAPD.
193
204
http://jstnar.iut.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-2-475&slc_lang=fa&sid=1
F. Shokoohifar
فرهاد شکوهیفر
00031947532846005173
00031947532846005173
Yes
A. Bagheri
عبدالرضا باقری
00031947532846005174
00031947532846005174
No
M. Falahati Rastegar
ماهرخ فلاحتی رستگار
00031947532846005175
00031947532846005175
No