Journal of Water and Soil Science
علوم آب و خاک
jwss
Agriculture
http://jstnar.iut.ac.ir
0
user
2476-3594
2476-5554
10.47176/jwss
fa
jalali
1378
7
1
gregorian
1999
10
1
3
3
online
1
fulltext
fa
استفاده از کروماتوگرافی مایع فاز معکوس با کارایی بالا (RP-HPLC) در بررسی تنوع ژنتیکی گندم نان
Capability of Reversed-Phase High-Performance Liquid Chromatography (RP-HPLC) in the study of Genetic Variation in Bread Wheat
عمومی
Ggeneral
پژوهشي
Research
<p>این مطالعه به منظور ارزیابی قابلیت روش کروماتوگرافی مایع فاز معکوس با کارایی بالا (RP-HPLC) در بررسی پروتئینهای ذخیرهای و تنوع ژنتیکی آن در ایزولاینهای بهاره و پاییزه، ارقام زراعی و بومی گندم نان اجرا گردید. پروتئینهای گلیادین حاصل از آرد 5 بذر تصادفی از هر ژنوتیپ، با روش RP-HPLC تجزیه شدند. در این روش از ستون Nucleosil C18 300A و یک ستون محافظ و حلال متحرک استونیتریل حاوی TFA استفاده شد.</p><p> کلیه شرایط انتخاب شده برای تجزیه پروتئینهای ذخیرهای، اهداف این مطالعه را با منظور نمودن سرعت و بازده جداسازی مناسب تأمین نمود. تحت این شرایط تعداد اجزای حاصل از تجزیه گلیادینها بیشتر از ریزواحدهای تجزیه الکتروفورز بود. به علاوه نتایج کمی حاصل از تجزیه RP-HPLC، تجزیه و تحلیل آماری دادهها را آسان نمود. همچنین تجزیه گلیادینها با روش RP-HPLC قابلیت بالایی در شناسایی ژنهای چاودار داشت، به طوری که به سهولت حضور سکالینهای امگا در ژنوم رقم فلات را معلوم کرد. بنابراین نتیجهگیری شد که تجزیه RP-HPLC پروتئینهای گلیادین میتواند کارآیی روش الکتروفورز را داشته باشد و حتی در مواردی جایگزین آن شود. نتایج تجزیه خوشهای پلیپپتیدهای گلیادین بیانگر افزایش تدریجی تنوع ژنتیکی از ایزولاینها تا ارقام بومی بود. در مجموع، در بین ارقام بومی، گندمهای علی آباد، عقدا، سفید بافقی، قرمز بافقی، شهداس و سرخه از تنوع ژنتیکی بیشتری برخوردار بودند. </p>
<p>This study was conducted to evaluate the capability of reversed-phase high performance liquid chromatography (RP-HPLC) of wheat (<em>Triticum aestivum</em> L.) storage proteins, and their genetic variability in different winter and spring isolines, cultivars and landraces. Gliadin proteins were extracted from the flour of five randomly selected seeds of each genotype. In this method, Nucleosil C18 300 A column (250×4.6 mm ID), equipped with a guard column and acetonitrile containing TFA as mobile phase was used. </p><p>All selected conditions for RP-HPLC such as suitable velocity and resolution were sufficient to achieve the objectives of this study. Under these conditions, the number of gliadin components by RP-HPLC analysis was more than electrophoresis subunits. In addition, quantitative results of RP-HPLC facilitated the data analysis. Also gliadin analysis by RP-HPLC had a high potential in detecting rye (<em>Secale cereale</em> L.) genes, so that the presence of ω-secalins in the genome of Falat variety was easily detected. Therefore, it was concluded that RP-HPLC analysis of gliadin proteins is as efficient as electrophoresis, and could even replace it in some cases. The result of cluster analysis for gliadin polypeptides indicated the gradual increase of genetic variation from isolines to landraces. Generally speaking, among the landraces, Ali Abad, Aghda, Sefid Bafghi, Ghermez Bafghi, Shahdas and Sorkheh had greater genetic variations. </p>
ارقام بومی ، ایزولاین ، تجزیه خوشه ای ، زیرواحدهای پروتئین ، گلیادین ، مولفه های اصلی
Landraces, Isolines, Cluster analysis, Protein subunits, Gliadin, Principal components
41
60
http://jstnar.iut.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-2-3&slc_lang=fa&sid=1
R.
Amiri
رضا
امیری
00031947532846007243
00031947532846007243
Yes
A.
Rezai
عبدالمجید
رضایی
00031947532846007244
00031947532846007244
No
M.
Shahedi
محمد
شاهدی
00031947532846007245
00031947532846007245
No
S.
Dokhani
شهرام
دخانی
00031947532846007246
00031947532846007246
No